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石油是烷烃、烯烃和芳香烃的混合物，进入水体后的危害是多方面的。如在水上形成油膜，能阻碍水体复氧作用，油类粘附在鱼鳃上，水母缸迷你，可使鱼窒息；粘附在藻类、浮游生物上，可使它们。油类会抑制水鸟产卵和孵化，严重时使鸟类大量。石油污染还能使水产品质量降低。
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1909年德国学者B·科尔克维茨和M·马松对一些受有机物污染的河流的生物分布情况进行了调查，发现河流的不同污染带，汕头水母缸，存在着表示这一污染带特性的生物。他们在此基础上提出了指示生物的概念。例如水中存在着责翅目、蜉蝣目稚虫或毛翅目幼虫，水质一般比较清洁
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因此，水体富营养化后，即使切断外界营养物质的来源，也很难自净和恢复到正常水平。水体富养化严重时，湖泊可被某些繁生植物及其残骸淤塞，成为沼泽甚至干地。局部海区可变成'死海'，或出现'赤潮'现象。
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